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賴(lài)旭龍教授、盛桂蓮教授團(tuán)隊(duì),BGEG國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/地球科學(xué)學(xué)院/環(huán)境學(xué)院, iScience (2023), Relationships of Late Pleistocene Giant Deer as Revealed by Sinomegaceros Mitogenomes from East Asia

發(fā)表時(shí)間:2023-11-14     點(diǎn)擊:次     編輯:顧剛

2023年11月7日,我校賴(lài)旭龍教授、盛桂蓮教授領(lǐng)導(dǎo)的古DNA團(tuán)隊(duì)與英國(guó)自然歷史博物館、中科院古脊椎動(dòng)物與古人類(lèi)研究所等國(guó)內(nèi)外機(jī)構(gòu)合作研究的成果“Relationships of Late Pleistocene Giant Deer as Revealed bySinomegacerosMitogenomes from East Asia(東亞中華大角鹿線(xiàn)粒體基因組揭示晚更新世大角鹿系統(tǒng)演化關(guān)系)”在線(xiàn)發(fā)表于CellPress旗下期刊《iScience》。地球科學(xué)學(xué)院博士生肖博為第一作者,我校賴(lài)旭龍教授、盛桂蓮教授和英國(guó)自然歷史博物館AdrianM.Lister教授為共同通訊作者。

大角鹿是第四紀(jì)晚期動(dòng)物群中的已滅絕成員,曾廣泛分布于亞歐大陸北部區(qū)域,其碩大的體型和奇特的鹿角吸引了學(xué)界和公眾的目光。此前根據(jù)各地出土的大角鹿化石的形態(tài)學(xué)研究認(rèn)為東亞地區(qū)的大角鹿與歐洲和中亞的大角鹿有明顯差異,并以此將大角鹿分作兩個(gè)屬:亞歐大陸中、西部的歐洲大角鹿屬(Megaloceros)和東亞地區(qū)的中華大角鹿屬(Sinomegaceros)。隨著古DNA技術(shù)的發(fā)展,國(guó)際同行已于2021年對(duì)歐洲大角鹿的樣本開(kāi)展了分子譜系地理研究,本研究是首例中華大角鹿古基因組研究。

圖1大角鹿頭骨、鹿角形態(tài)特征

(a)歐洲大角鹿;(b)中華大角鹿之河套大角鹿;(c)中華大角鹿之腫骨鹿

我校古DNA團(tuán)隊(duì)及合作者從我國(guó)東北和華北、俄羅斯遠(yuǎn)東和日本等地采集了十多件大角鹿化石樣本,基于6件樣品的線(xiàn)粒體古基因組數(shù)據(jù),通過(guò)構(gòu)建貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)并分析大角鹿線(xiàn)粒體單倍型,發(fā)現(xiàn)所研究的中華大角鹿分屬3個(gè)母系遺傳支系,在線(xiàn)粒體系統(tǒng)樹(shù)上與歐洲大角鹿并未發(fā)生分歧。根據(jù)樣品發(fā)掘地點(diǎn)、原認(rèn)為是歐洲大角鹿的西伯利亞貝加爾地區(qū)的樣品,經(jīng)分子鑒定為中華大角鹿;該樣品代表的遺傳支系與歐洲大角鹿在該地區(qū)的共存,表明中華大角鹿與歐洲大角鹿存在地理分布區(qū)域的重疊。此外,本研究在中國(guó)東北發(fā)現(xiàn)了從末次盛冰期前延續(xù)至末次盛冰期的中華大角鹿遺傳支系,意味著中國(guó)東北可能是大角鹿等動(dòng)物在末次盛冰期時(shí)的避難所之一;中華大角鹿骨骼樣品的碳、氮穩(wěn)定同位素分析結(jié)果顯示,氣候波動(dòng)導(dǎo)致的植被變化與中華大角鹿在中國(guó)東北的地區(qū)絕滅之間存在相關(guān)性。

圖2歐洲大角鹿和中華大角鹿分布區(qū)域及大角鹿線(xiàn)粒體基因組系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

(Cladesino1-3為中華大角鹿遺傳支系)

我校古DNA團(tuán)隊(duì)近年來(lái)對(duì)鹿科動(dòng)物開(kāi)展了“多物種-跨時(shí)空”古基因組聯(lián)合研究,發(fā)現(xiàn)鹿科不同物種在第四紀(jì)氣候變化和人類(lèi)活動(dòng)雙重因素作用下呈現(xiàn)的分子響應(yīng)模式各不相同。本研究和該團(tuán)隊(duì)此前已發(fā)表的馬鹿(Xiaoet al., 2022QuaternaryScience Reviews)、東北狍(Deng et al., 2022 Genes)及正在進(jìn)行的駝鹿等物種的古DNA研究結(jié)果顯示,作為第四紀(jì)哺乳動(dòng)物中已滅絕物種的典型代表,大角鹿的遺傳多樣性在末次盛冰期前后有顯著降低,僅在避難所區(qū)域留下少數(shù)遺傳支系;馬鹿曾經(jīng)廣泛分布于歐亞大陸北部,受氣候變化和人類(lèi)活動(dòng)的共同影響,其有效種群大小及分布范圍有所縮減;駝鹿雖然受氣候影響發(fā)生了種群縮減,但是在末次盛冰期以后迅速重新占領(lǐng)了亞洲泛北極地區(qū),甚至擴(kuò)散到了北美地區(qū);而小型鹿科動(dòng)物——東北狍自末次盛冰期以來(lái),一直保持著穩(wěn)定的遺傳支系組成。通過(guò)對(duì)鹿科動(dòng)物中已滅絕物種和延續(xù)至今的物種在遺傳多樣性變化趨勢(shì)上的對(duì)比分析,解析不同物種的種群演化規(guī)律,對(duì)于系統(tǒng)重建氣候變化及人類(lèi)活動(dòng)雙重壓力下第四紀(jì)大型哺乳動(dòng)物種群演化歷史具有重要啟示意義。

上述所有研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(編號(hào):42172027)資助。

論文信息:

標(biāo)題: Relationships of Late Pleistocene Giant Deer as Revealed bySinomegacerosMitogenomes from East Asia

作者: Bo Xiao, Alba Rey-lglesia, Junxia Yuan, Jiaming Hu, Shiwen Song, Yamei Hou, Xi Chen, Mietje Germonpré, Lei Bao, Siren Wang, Taogetongqimuge, Lbova Liudmila Valentinovna, Adrian M. Lister*, Xulong Lai*, and Guilian Sheng*.

原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.108406